49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2385 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  100 
 
 		 610 aa  1239    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  49.24 
 
 		 625 aa  559  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  45.58 
 
 		 601 aa  529  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 647 aa  236  9e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 652 aa  230  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 641 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  26.36 
 
 		 660 aa  206  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 716 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  26.06 
 
 		 536 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 715 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  24.47 
 
 		 625 aa  157  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.61 
 
 		 802 aa  154  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 807 aa  147  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.65 
 
 		 684 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  23.7 
 
 		 697 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 306 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  24.01 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 678 aa  114  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  25.16 
 
 		 349 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 224 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  27.21 
 
 		 329 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  25.08 
 
 		 349 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 307 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 679 aa  96.3  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 328 aa  91.3  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  24.8 
 
 		 332 aa  83.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  26.39 
 
 		 290 aa  70.1  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  26.86 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  21.75 
 
 		 658 aa  56.6  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  26.38 
 
 		 581 aa  55.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 582 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  22 
 
 		 317 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  23.49 
 
 		 273 aa  51.2  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 295 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  26.34 
 
 		 578 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  25 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  19.61 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  25.32 
 
 		 261 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4348  type II secretion system protein  30 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  19.78 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5620  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 287 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  25.52 
 
 		 558 aa  44.3  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 426 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>