30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1648 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  100 
 
 		 590 aa  1171    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 604 aa  248  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  26.12 
 
 		 616 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  24.4 
 
 		 658 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  25.23 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  21.34 
 
 		 647 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  23.95 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  24.35 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  23.35 
 
 		 296 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  23.51 
 
 		 349 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  20.31 
 
 		 678 aa  55.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 307 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  20.7 
 
 		 641 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 644 aa  52.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  25.27 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 295 aa  51.2  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  23.08 
 
 		 601 aa  50.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  22.98 
 
 		 652 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.78 
 
 		 610 aa  48.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 807 aa  48.5  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  19.26 
 
 		 660 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  20.89 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  18.95 
 
 		 684 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  22.36 
 
 		 329 aa  44.3  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 224 aa  43.9  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>