35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0777 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  100 
 
 
284 aa  553  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  35.09 
 
 
601 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  30.2 
 
 
715 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  28.45 
 
 
625 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  28.8 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  30.82 
 
 
610 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  28.26 
 
 
644 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  27.23 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  27.66 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  26.79 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  26.13 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  29.79 
 
 
641 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  27.64 
 
 
625 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  28.57 
 
 
660 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  25.39 
 
 
604 aa  63.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  27.89 
 
 
652 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  25.71 
 
 
296 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  24.54 
 
 
647 aa  62  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  30.15 
 
 
590 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0854  type II secretion system protein  27.31 
 
 
261 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.243873  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.81 
 
 
684 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  26.71 
 
 
536 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25.16 
 
 
697 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  25.37 
 
 
261 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.11 
 
 
802 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  22.28 
 
 
658 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.92 
 
 
678 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  28.8 
 
 
679 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1869  type II secretion system protein  27.09 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1402  type II secretion system protein  27.09 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.99 
 
 
574 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  21.99 
 
 
300 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  22.49 
 
 
807 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  28.26 
 
 
680 aa  46.2  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  26.29 
 
 
282 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>