46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0229 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  56.6 
 
 
578 aa  679    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  68.95 
 
 
581 aa  825    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  100 
 
 
582 aa  1187    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  51.93 
 
 
574 aa  609  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  46.53 
 
 
577 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  32.51 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  31.97 
 
 
558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  31.01 
 
 
554 aa  303  6.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  31.24 
 
 
558 aa  297  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  31.18 
 
 
558 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  30.43 
 
 
558 aa  289  8e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  29.13 
 
 
558 aa  266  7e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  21.79 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  24.08 
 
 
534 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  23.48 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  24.88 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  24.34 
 
 
545 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  19.17 
 
 
539 aa  97.4  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  26.94 
 
 
307 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  25.99 
 
 
697 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  25 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  25.74 
 
 
224 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  23.64 
 
 
716 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  22.69 
 
 
680 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  25.95 
 
 
684 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  21.89 
 
 
604 aa  60.5  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  22.51 
 
 
300 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  20.65 
 
 
306 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  19.7 
 
 
475 aa  57.8  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  23.68 
 
 
625 aa  57.4  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  19.92 
 
 
601 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  18.18 
 
 
332 aa  54.3  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.24 
 
 
610 aa  53.9  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  21.32 
 
 
647 aa  53.5  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  22.06 
 
 
679 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1345  type II secretion system protein  25.65 
 
 
261 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.24164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  21.58 
 
 
678 aa  52.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  18.99 
 
 
473 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  23.35 
 
 
652 aa  50.4  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  24.76 
 
 
644 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  25 
 
 
715 aa  47.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  28.33 
 
 
807 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  21.71 
 
 
625 aa  46.2  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0127  type II secretion system protein  23.38 
 
 
630 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.887891  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  23.21 
 
 
290 aa  44.3  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  22.84 
 
 
660 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>