53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2147 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  62.84 
 
 
684 aa  871    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  62.5 
 
 
697 aa  840    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  100 
 
 
679 aa  1366    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  67.6 
 
 
678 aa  917    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  63.98 
 
 
680 aa  824    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  28.05 
 
 
716 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  29.22 
 
 
652 aa  258  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  28.05 
 
 
644 aa  236  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  27.77 
 
 
641 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  26.32 
 
 
647 aa  219  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  27.4 
 
 
715 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  24.15 
 
 
660 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25.55 
 
 
807 aa  185  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  23.04 
 
 
625 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  27.03 
 
 
802 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  26.81 
 
 
536 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  22.53 
 
 
601 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2054  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
633 aa  127  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.647087  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  32.25 
 
 
306 aa  125  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25.6 
 
 
625 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  27.36 
 
 
349 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  22.41 
 
 
610 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  29.06 
 
 
349 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  26.28 
 
 
328 aa  103  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  29.44 
 
 
307 aa  101  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  27.13 
 
 
329 aa  98.2  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  27.65 
 
 
296 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  30.29 
 
 
224 aa  97.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  28.8 
 
 
332 aa  89.4  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  27.6 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  24.36 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  26.06 
 
 
558 aa  64.3  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  22.96 
 
 
578 aa  63.9  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  25.35 
 
 
558 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  25.35 
 
 
558 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.91 
 
 
284 aa  62.8  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  21.74 
 
 
581 aa  61.6  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  26.76 
 
 
558 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  23.94 
 
 
558 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.22 
 
 
574 aa  59.3  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  20.28 
 
 
582 aa  58.9  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  20.68 
 
 
590 aa  55.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  21.77 
 
 
450 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  23.76 
 
 
554 aa  53.9  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  23.53 
 
 
300 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  23.5 
 
 
620 aa  47  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.81 
 
 
295 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  24.66 
 
 
311 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  19.51 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  21.8 
 
 
272 aa  45.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  24.05 
 
 
310 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  25.12 
 
 
658 aa  43.9  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  21.69 
 
 
551 aa  43.9  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>