35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0996 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  100 
 
 
558 aa  1130    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  95.7 
 
 
558 aa  1054    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  60.39 
 
 
558 aa  724    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  84.23 
 
 
558 aa  981    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  93.73 
 
 
558 aa  1041    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  35.03 
 
 
551 aa  363  4e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  31.88 
 
 
574 aa  319  1e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  30.78 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  31.81 
 
 
554 aa  295  1e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  30.34 
 
 
582 aa  286  9e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  31.86 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  30.1 
 
 
577 aa  273  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  21.38 
 
 
517 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.36 
 
 
539 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  20.25 
 
 
532 aa  77  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  21.75 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  21.22 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  22.86 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  24.65 
 
 
678 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  20.68 
 
 
534 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  22.77 
 
 
697 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  24.82 
 
 
679 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  24.41 
 
 
684 aa  57  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  19.5 
 
 
475 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  21.83 
 
 
680 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  22.29 
 
 
716 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  23.36 
 
 
332 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  25.36 
 
 
807 aa  47.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  24.41 
 
 
715 aa  46.6  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  24.59 
 
 
652 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  26.27 
 
 
290 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  26.49 
 
 
802 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  22.42 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  23.88 
 
 
307 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  22.97 
 
 
224 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>