30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3411 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3411  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
577 aa  1167    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  48.97 
 
 
581 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  46.53 
 
 
582 aa  550  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  46.83 
 
 
578 aa  525  1e-148  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  44.86 
 
 
574 aa  512  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  32.25 
 
 
551 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  29.65 
 
 
554 aa  290  6e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  30.26 
 
 
558 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  30.71 
 
 
558 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  30.3 
 
 
558 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  31.18 
 
 
558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  29.43 
 
 
558 aa  274  3e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1341  flagellar assembly protein J  25.71 
 
 
546 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.279936 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  23.09 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0948  flagellar assembly protein J  24.41 
 
 
532 aa  107  7e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0756318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0105  flagellar assembly protein J  23.37 
 
 
534 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.461814  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0353  flagellar assembly protein J  22.19 
 
 
539 aa  95.9  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.584912  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1861  flagellar assembly protein J  23.53 
 
 
545 aa  92.8  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0127  Type II secretion system F domain protein  22.5 
 
 
473 aa  69.3  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366598  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1324  flagella assembly protein J-like protein  20 
 
 
475 aa  61.6  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000149145  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  21.84 
 
 
307 aa  60.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  23.58 
 
 
296 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  24.89 
 
 
306 aa  57.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  20 
 
 
224 aa  54.7  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  23.96 
 
 
660 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  17.89 
 
 
716 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  22.79 
 
 
625 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  25.88 
 
 
802 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  24.14 
 
 
658 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  19.1 
 
 
332 aa  43.9  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>