86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1065 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 
536 aa  1056    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  43.86 
 
 
807 aa  412  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  46.89 
 
 
715 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  44.09 
 
 
802 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  33.58 
 
 
644 aa  326  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  33.79 
 
 
641 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  33.7 
 
 
716 aa  307  3e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  34.76 
 
 
652 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  31.53 
 
 
647 aa  296  9e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  29.55 
 
 
660 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  28.15 
 
 
625 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  26.78 
 
 
610 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  27.36 
 
 
697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  28.46 
 
 
684 aa  180  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  25.56 
 
 
625 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  23.16 
 
 
601 aa  163  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  26.39 
 
 
678 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  26.72 
 
 
680 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  26.79 
 
 
679 aa  150  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  32.45 
 
 
349 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  27.8 
 
 
328 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  30.52 
 
 
349 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  30.56 
 
 
329 aa  133  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  29.71 
 
 
290 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  34.07 
 
 
307 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  32.62 
 
 
296 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  28.8 
 
 
224 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  27.78 
 
 
306 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  21.91 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  27.59 
 
 
332 aa  79.3  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.83 
 
 
295 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  28.73 
 
 
300 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  29.09 
 
 
293 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  22.28 
 
 
317 aa  57.4  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  25.79 
 
 
615 aa  56.6  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.219631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  29.22 
 
 
307 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  26.87 
 
 
284 aa  54.7  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1343  type II secretion system protein  28.7 
 
 
256 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.753846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  30.34 
 
 
320 aa  53.5  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  20.19 
 
 
604 aa  53.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  30.77 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6878  type II secretion system protein  29.77 
 
 
293 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.465681  normal  0.240753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  27.88 
 
 
287 aa  51.6  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  28.86 
 
 
304 aa  51.6  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  35.04 
 
 
325 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  24.12 
 
 
311 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1125  type II secretion system protein  26.97 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.11 
 
 
279 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  29.37 
 
 
328 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  25.77 
 
 
287 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.63 
 
 
325 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  21.61 
 
 
307 aa  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.9 
 
 
282 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  27.68 
 
 
282 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  27.86 
 
 
331 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.59 
 
 
313 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  26.62 
 
 
287 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  28.15 
 
 
660 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  24.24 
 
 
294 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3795  type II secretion system protein  27.91 
 
 
321 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  35 
 
 
330 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  26.05 
 
 
535 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  28.95 
 
 
323 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0238  type II secretion system protein  29.17 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  31.62 
 
 
325 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  25.38 
 
 
310 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4205  type II secretion system protein  26.11 
 
 
324 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125721  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3718  type II secretion system protein  27.14 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.202594  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0386  type II secretion system protein  27.86 
 
 
325 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  27.72 
 
 
325 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  25.5 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3525  type II secretion system protein  26.35 
 
 
324 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.359223  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  28.1 
 
 
316 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  28.03 
 
 
313 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  26.19 
 
 
291 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  29.45 
 
 
301 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  22.13 
 
 
551 aa  43.9  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.21 
 
 
325 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.21 
 
 
325 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.97 
 
 
314 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.21 
 
 
325 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  22.69 
 
 
323 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  26.62 
 
 
330 aa  43.5  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0296  type II secretion system protein  27.86 
 
 
325 aa  43.5  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  28.71 
 
 
273 aa  43.5  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2566  Type II secretion system F domain protein  26.57 
 
 
306 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>