282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1317 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 
325 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  99.69 
 
 
325 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  99.69 
 
 
325 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  93.23 
 
 
325 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  73.1 
 
 
325 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  71.84 
 
 
325 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  70.03 
 
 
325 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  70.43 
 
 
325 aa  467  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  70.12 
 
 
325 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  70.12 
 
 
325 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  60.92 
 
 
325 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  58.46 
 
 
325 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  56.62 
 
 
325 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  56.57 
 
 
325 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  54.91 
 
 
326 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  52.62 
 
 
325 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  49.39 
 
 
323 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  46.34 
 
 
325 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  47.55 
 
 
325 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  45.6 
 
 
330 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  45.54 
 
 
322 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  41.38 
 
 
321 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  39.12 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  43.13 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  39.54 
 
 
321 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  35.53 
 
 
325 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  39 
 
 
322 aa  194  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  36.17 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  32.81 
 
 
323 aa  186  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  46.35 
 
 
320 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  36.57 
 
 
320 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  45.45 
 
 
322 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.32 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  34.19 
 
 
321 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  32.55 
 
 
322 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  30.95 
 
 
322 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  34.73 
 
 
321 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.9 
 
 
320 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  39.2 
 
 
323 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.38 
 
 
322 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  32 
 
 
322 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  32 
 
 
322 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  32.03 
 
 
317 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.98 
 
 
320 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.31 
 
 
322 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.23 
 
 
321 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  39.58 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  40.4 
 
 
314 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.75 
 
 
316 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  30.41 
 
 
325 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  29.57 
 
 
322 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  29.63 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  31.86 
 
 
324 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  37.57 
 
 
660 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  34.03 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  35.81 
 
 
333 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  41.58 
 
 
313 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  39.01 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  39.8 
 
 
332 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  30.24 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  35.64 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  34.6 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  29.72 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  32.6 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  34.43 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  31.34 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  30.13 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.51 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.64 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  30.38 
 
 
324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  34.47 
 
 
325 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  38.51 
 
 
327 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.47 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  32.31 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  38.51 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.92 
 
 
323 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  29.39 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  31.96 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.83 
 
 
324 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  35.89 
 
 
336 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  30.69 
 
 
315 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  32.91 
 
 
316 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  37.16 
 
 
275 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  32.24 
 
 
327 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  33.33 
 
 
336 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  34.03 
 
 
284 aa  123  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  34.44 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.27 
 
 
324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  29.97 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  38.54 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  36.13 
 
 
326 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.51 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  39.19 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  35 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  34.23 
 
 
325 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  34.23 
 
 
325 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  36.52 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  34.08 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  36.21 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  35.56 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>