267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1753 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 325 aa  653    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  39.69 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  39.21 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  36.28 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  37.39 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  37.01 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  38.36 
 
 		 325 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  37.9 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  36.42 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  35.28 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  35.86 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  35.86 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  35.86 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  36.3 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  36.51 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  35.53 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 325 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  35.94 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  35.74 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  33.94 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  34.65 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  38.69 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  40.61 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  35.69 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.69 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  38.85 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  45.31 
 
 		 321 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  44.5 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 322 aa  172  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  39.04 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  33.23 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  40.69 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  33.12 
 
 		 320 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  33 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  36.84 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 317 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  41.4 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  33 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  30.95 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  31 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  35.83 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  40 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  29.49 
 
 		 322 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  41.57 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  36.91 
 
 		 325 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.36 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  32.84 
 
 		 329 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  35.18 
 
 		 660 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  36.04 
 
 		 282 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  37.63 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  32.64 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  31.13 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 324 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  27.02 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  34.33 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.94 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 324 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  36.72 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  34.64 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  29.89 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  36.52 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 335 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 325 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.27 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>