234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1523 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  100 
 
 		 328 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  48.66 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  34.16 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  36.31 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  37.63 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  34.56 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  34.8 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  34.8 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  36.22 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  42.49 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 325 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  42.27 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  38.78 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  33.02 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  33.6 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.04 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  39.06 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  40.4 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  39.58 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  39.58 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  40.7 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  38.68 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  39.06 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  36.55 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  37.43 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  38.39 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  32.69 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  30.8 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  40.1 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  37.44 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  34.31 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  29.17 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.96 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  26.73 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  36.27 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.64 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  31.38 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  29.02 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  34.69 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  28 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.5 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  30.24 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  37.5 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.3 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  39.86 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  38.78 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  34.36 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  32.79 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  33.79 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>