251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0727 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  100 
 
 
337 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  53.41 
 
 
337 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  55.45 
 
 
335 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  56.13 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  52.23 
 
 
334 aa  330  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  55.03 
 
 
336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  48.62 
 
 
324 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  48.24 
 
 
324 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  45.07 
 
 
338 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  47.37 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  44.75 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  45.54 
 
 
323 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  46.13 
 
 
324 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  49.63 
 
 
323 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  43.2 
 
 
328 aa  266  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  45.57 
 
 
323 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  45.99 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  44.08 
 
 
322 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  45.99 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  49.45 
 
 
322 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  45.14 
 
 
327 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  45.09 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  42.38 
 
 
332 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  44.77 
 
 
325 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  42.14 
 
 
325 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  35.76 
 
 
324 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  34.74 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  35.18 
 
 
310 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.15 
 
 
322 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  29.08 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.57 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  31.78 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.15 
 
 
322 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  38.64 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.62 
 
 
321 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  31.72 
 
 
321 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.52 
 
 
325 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.52 
 
 
325 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  32.08 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  32.64 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  33.33 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  32.92 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  32.5 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  32.5 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.9 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  29.31 
 
 
321 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.39 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.14 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  29.48 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.34 
 
 
330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  31.12 
 
 
325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  32.77 
 
 
331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  28.97 
 
 
323 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  31.98 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  32.89 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  32.2 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  34.04 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.64 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  32.47 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.38 
 
 
320 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.4 
 
 
325 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  30.97 
 
 
333 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.88 
 
 
325 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.29 
 
 
321 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.55 
 
 
325 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.17 
 
 
326 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.58 
 
 
325 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.17 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.85 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  33.48 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  32.13 
 
 
316 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.38 
 
 
325 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  30.57 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.47 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.74 
 
 
335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.58 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  29.9 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  27.36 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  24.4 
 
 
322 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  31.89 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.58 
 
 
660 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.34 
 
 
322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  25.7 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  29.15 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  26.89 
 
 
329 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  28.02 
 
 
293 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25.48 
 
 
327 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  30.21 
 
 
325 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.92 
 
 
322 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  33.33 
 
 
329 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29 
 
 
279 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  30.9 
 
 
326 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>