289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4156 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  100 
 
 		 323 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  87.62 
 
 		 335 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  35.15 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  35.78 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  35.12 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  34.77 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  31.94 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  36.14 
 
 		 660 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  38.93 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.52 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  31 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  36.32 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 326 aa  134  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.39 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.29 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  33.98 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  34.58 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 316 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.9 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.7 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.9 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.53 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  32.44 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  34.04 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 322 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  35.64 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  29.84 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.43 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  30.88 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 336 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.55 
 
 		 334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 326 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  29.88 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  27.82 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.75 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  36.7 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 338 aa  109  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  29.3 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25.93 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.47 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  31.15 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.07 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.69 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  30 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  23.9 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  29.95 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.93 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.16 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  30.73 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 331 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  30.73 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>