245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0651 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  100 
 
 		 325 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  67.69 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  49.24 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  46.46 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  47.4 
 
 		 325 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  45.85 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  45.54 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  47.32 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  47.32 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  48.47 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  45.29 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  45.9 
 
 		 325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  46.56 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  46.58 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  46.58 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  46.58 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  43.43 
 
 		 323 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  42.77 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  42.09 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  42.46 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  36.91 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.8 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  34.32 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  34.67 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  35.33 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  34.45 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  36.51 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  33.55 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  42.78 
 
 		 322 aa  165  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  32.48 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  36.22 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  35.76 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.04 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  38.58 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  33.55 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  30.17 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  31.17 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  32.82 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.93 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.76 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  34.54 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  32.29 
 
 		 282 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  39.6 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 285 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  38.12 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  39.06 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.07 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  36.17 
 
 		 660 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  35.24 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  35.68 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  35.21 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  32.49 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  36.5 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  30.16 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  30.04 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  33.7 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  34.39 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  33.64 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.18 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.88 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  35.83 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  36.41 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.05 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.86 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  35.68 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  29.17 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  32.55 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  33.65 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  29.23 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 324 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.48 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.74 
 
 		 334 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.03 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>