248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0213 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  100 
 
 		 334 aa  672    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  68.59 
 
 		 335 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  67.42 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  68.18 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  56.89 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  50.76 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  46.71 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  46.69 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  45.65 
 
 		 324 aa  298  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  46.25 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  46.11 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  46.55 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  47.45 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  45.74 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  44.14 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  44.48 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  43.84 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  44.14 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  41.98 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  42.3 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  46.93 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  44.07 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  48.46 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  46.47 
 
 		 325 aa  245  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  44.74 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  38.41 
 
 		 324 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  33.86 
 
 		 310 aa  169  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  36.52 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  30.07 
 
 		 322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  28.52 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.74 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  38.07 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  33.33 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.16 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.03 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  37.16 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  29.39 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  29.9 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 321 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.64 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.93 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25.81 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 328 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.15 
 
 		 336 aa  116  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.17 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  32.29 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.69 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  28.27 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.93 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.59 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  30.26 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.86 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  30.26 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.74 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.32 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>