More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1018 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  100 
 
 
336 aa  671    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  33.23 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  39.68 
 
 
332 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  34.77 
 
 
327 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  37.85 
 
 
329 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  43.88 
 
 
327 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  35.88 
 
 
313 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  35.19 
 
 
321 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  33.53 
 
 
330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  39.06 
 
 
325 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.02 
 
 
325 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  36.93 
 
 
282 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  32.84 
 
 
335 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.94 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  35.29 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  36.84 
 
 
325 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  37.11 
 
 
321 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  35.83 
 
 
282 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  32.75 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  35.64 
 
 
279 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  33.73 
 
 
660 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  32.56 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  32.89 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  28.9 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.74 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  36.18 
 
 
325 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  36.92 
 
 
323 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  32.06 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  33.2 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  36.99 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  36.36 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.72 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  35.63 
 
 
310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  37.11 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.74 
 
 
325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  33.33 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.28 
 
 
316 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  35.86 
 
 
325 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.94 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.73 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  29.85 
 
 
335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  30.42 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.89 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  35.08 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  33.7 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  30.2 
 
 
323 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  30.2 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  35.06 
 
 
316 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.41 
 
 
317 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  35.2 
 
 
327 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  36.46 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  36.46 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  36.46 
 
 
325 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  37.39 
 
 
290 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  31.69 
 
 
323 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  34.85 
 
 
325 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  32.17 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  33.7 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  33.77 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  31.77 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  37.22 
 
 
310 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  31.41 
 
 
283 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.63 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  27.41 
 
 
336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  36.76 
 
 
320 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  36.27 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  30.22 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  34.44 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  34.44 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  30.33 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.15 
 
 
334 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  32.81 
 
 
535 aa  116  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.87 
 
 
324 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  29.23 
 
 
333 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  34.22 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  30.41 
 
 
309 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.73 
 
 
283 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.73 
 
 
322 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  34.62 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  33.16 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  27.14 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  30.04 
 
 
322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.51 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  31.75 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  34.82 
 
 
316 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  36.87 
 
 
321 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  32.88 
 
 
314 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  30.15 
 
 
322 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  27.96 
 
 
318 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  26.6 
 
 
328 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.68 
 
 
328 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  38.31 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  29.79 
 
 
324 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.12 
 
 
324 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  26.59 
 
 
283 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  27.2 
 
 
310 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.1 
 
 
324 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  31.79 
 
 
296 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  36.13 
 
 
289 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  31.52 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>