259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0237 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  100 
 
 		 328 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  52 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  48.44 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  46.2 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  50.32 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  50.62 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  48.75 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  48.02 
 
 		 324 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  46.25 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  47.87 
 
 		 334 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  47.4 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  48.04 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  48.26 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  46.2 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  50.72 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  46.69 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  48.62 
 
 		 322 aa  278  7e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  45.35 
 
 		 324 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  50.18 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  47.51 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  43.2 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  52.79 
 
 		 322 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  47.12 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  44.18 
 
 		 332 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  43.46 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  39.23 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  36.69 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  37.55 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  30.56 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  32.69 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  29.76 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  27.02 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.78 
 
 		 332 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  27.08 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  28.72 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  31.69 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  32.09 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  33.52 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 333 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.28 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.92 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  28.49 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  30 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.67 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  26.42 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25.38 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  26.98 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  25.23 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  25.82 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.42 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 322 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  24.15 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>