206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0899 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 326 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  95.09 
 
 		 326 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  67.38 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  47.56 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  27.95 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  36.78 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  32.96 
 
 		 324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  32.4 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  32.4 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  33.71 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  31.3 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  36.65 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 325 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.05 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  30.34 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  30.92 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  32.47 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  33.33 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.91 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  32.57 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  32.75 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  35.84 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.44 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  27.39 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  32.41 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.94 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  30.94 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  32.5 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 325 aa  99.8  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  31.46 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  32.02 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  32.2 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  34.86 
 
 		 321 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  34.02 
 
 		 320 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.33 
 
 		 325 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.33 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.87 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.7 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  31.5 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 320 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  29.94 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.76 
 
 		 322 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 283 aa  85.9  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.01 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  30.41 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  24.15 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.24 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  27.37 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>