179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03348 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  56.19 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  47.41 
 
 		 302 aa  268  7e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  39.67 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0681  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0598  type II secretion system protein F domain  34.86 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0261  type II secretion system protein F domain  33.71 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000564215  hitchhiker  0.000000175169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  32.71 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  34.44 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  32 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.51 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.25 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 325 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  31.97 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  28.83 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  29.51 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  23.08 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  29.51 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  23.21 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  29.51 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  29.51 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 331 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  21.74 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  21.26 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  26.34 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25.41 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.58 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  23.65 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  22.88 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25.75 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  23.64 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  21.2 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.76 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  23.16 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  23.16 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  23.16 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  25.14 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  22.02 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.6 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  22.31 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  23.73 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  20.52 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  22.73 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  21.89 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  22.86 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  22.56 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  25.25 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  21.89 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  22.4 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  28.39 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>