246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0423 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  100 
 
 
327 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  50.94 
 
 
328 aa  322  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  48.03 
 
 
335 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  47.37 
 
 
335 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  46.6 
 
 
324 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  46.58 
 
 
324 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  49.38 
 
 
324 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  46.41 
 
 
325 aa  275  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  46.84 
 
 
324 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  45.65 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  42.86 
 
 
337 aa  265  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  45.65 
 
 
324 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  47.19 
 
 
324 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  42.16 
 
 
334 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  42.5 
 
 
338 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  42.25 
 
 
337 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  46.01 
 
 
336 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  47 
 
 
322 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  44.91 
 
 
322 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  45.76 
 
 
327 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  44.65 
 
 
332 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  45.05 
 
 
323 aa  225  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  45.05 
 
 
323 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  42.86 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  39.85 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  35.53 
 
 
324 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  37.99 
 
 
310 aa  176  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  35.54 
 
 
324 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  33.33 
 
 
328 aa  140  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.33 
 
 
330 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  33.33 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  33.33 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  33.33 
 
 
331 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  33.33 
 
 
331 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.38 
 
 
322 aa  123  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  33.68 
 
 
332 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  28.12 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  34.03 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  32.88 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  28.94 
 
 
317 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.25 
 
 
325 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  36.82 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  27.09 
 
 
309 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.74 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.74 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  29.09 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.56 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.2 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  24.74 
 
 
322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  33.71 
 
 
321 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.2 
 
 
310 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  31.67 
 
 
330 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.22 
 
 
325 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.18 
 
 
323 aa  116  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  27.97 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  28.73 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.37 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.61 
 
 
325 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  31.3 
 
 
326 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.37 
 
 
325 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  30.25 
 
 
319 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.85 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.14 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  26.45 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  26.67 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  22.52 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  29.57 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.14 
 
 
336 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.67 
 
 
325 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  30.64 
 
 
325 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  28.43 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.64 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  30.05 
 
 
321 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.3 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  28.37 
 
 
321 aa  108  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  31.66 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.04 
 
 
323 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.21 
 
 
325 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.04 
 
 
325 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25.08 
 
 
325 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  32 
 
 
310 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  26.15 
 
 
323 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  31.58 
 
 
326 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.35 
 
 
325 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.41 
 
 
316 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.15 
 
 
325 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  23.38 
 
 
335 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.32 
 
 
322 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.15 
 
 
325 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.15 
 
 
325 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  32.94 
 
 
317 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.29 
 
 
290 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  30.34 
 
 
325 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  29.43 
 
 
320 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.73 
 
 
313 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.18 
 
 
320 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  30.27 
 
 
314 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  28.29 
 
 
316 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>