255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5121 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  100 
 
 		 332 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  66.46 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  57.75 
 
 		 327 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  46.88 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  45.82 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  48.61 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  45.6 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  50 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  46.27 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  49.32 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  50.92 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  45.82 
 
 		 324 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  44.18 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  44.44 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  48.06 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  48.89 
 
 		 335 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  44.52 
 
 		 335 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  46.43 
 
 		 336 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  43.87 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  42.38 
 
 		 337 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  50.18 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  46.67 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  44.98 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  47.23 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  44.04 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  34.6 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  39.02 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  39.41 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.52 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.91 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  35.55 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.92 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.02 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  32.17 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  33.69 
 
 		 321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.23 
 
 		 320 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  32.11 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  26.75 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  32.11 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  40.35 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.74 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.52 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.58 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  32.6 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  32.14 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  31.62 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  33.92 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.46 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 328 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 319 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  34.12 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25.52 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.1 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  25.61 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  25.15 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  25.61 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  31.77 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  23.43 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.55 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.36 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.1 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 315 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.27 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.99 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 316 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  32.54 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  30.21 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>