219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2699 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  100 
 
 
321 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  47.17 
 
 
320 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  46.54 
 
 
320 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  44.24 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  35.8 
 
 
325 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  35.65 
 
 
325 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  35.19 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  36.05 
 
 
325 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.88 
 
 
325 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.35 
 
 
325 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  35.28 
 
 
325 aa  178  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  44.74 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  35.28 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  34.7 
 
 
325 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  33.33 
 
 
325 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  34.94 
 
 
325 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  34.94 
 
 
325 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  35.6 
 
 
325 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  33.44 
 
 
325 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.62 
 
 
325 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.86 
 
 
326 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  32.92 
 
 
325 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  33.02 
 
 
325 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.28 
 
 
330 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  29.38 
 
 
323 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  32.59 
 
 
325 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  35 
 
 
322 aa  153  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  31.78 
 
 
323 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  39.2 
 
 
320 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.52 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  34.02 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  31.66 
 
 
309 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  30.58 
 
 
321 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.36 
 
 
332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.5 
 
 
322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.87 
 
 
322 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.01 
 
 
320 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  31.27 
 
 
322 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  33.76 
 
 
322 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.14 
 
 
660 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  39.18 
 
 
327 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  39.18 
 
 
327 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  29.19 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  33.8 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.57 
 
 
335 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  32.98 
 
 
323 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  31.13 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27.97 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  31.13 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  38.54 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  32.22 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.22 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  33.06 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  29.08 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  31.25 
 
 
329 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.34 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.37 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  30.82 
 
 
322 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  31.54 
 
 
335 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.66 
 
 
317 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  34.59 
 
 
279 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  32.09 
 
 
282 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.05 
 
 
334 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  30.13 
 
 
310 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  28.52 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  29.37 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.87 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  31.63 
 
 
282 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  34.05 
 
 
283 aa  119  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  35.89 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  29.1 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  35.2 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  37.66 
 
 
332 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  29.35 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  34.04 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  32.92 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  32.62 
 
 
325 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  32.97 
 
 
283 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.83 
 
 
323 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.34 
 
 
324 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.97 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  26.58 
 
 
325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  28.45 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.93 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  32.6 
 
 
323 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  31.87 
 
 
324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  25.94 
 
 
338 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.8 
 
 
290 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  31.87 
 
 
325 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  31.89 
 
 
284 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.8 
 
 
328 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  28.1 
 
 
333 aa  106  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  30.95 
 
 
316 aa  105  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  33.69 
 
 
327 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  30.22 
 
 
324 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  30.77 
 
 
324 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  32.77 
 
 
283 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  26.12 
 
 
324 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.22 
 
 
324 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  32.97 
 
 
322 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>