219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2831 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  100 
 
 		 322 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  81.99 
 
 		 322 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  55.42 
 
 		 323 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  54.8 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  54.8 
 
 		 323 aa  348  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  52.62 
 
 		 324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  48.92 
 
 		 324 aa  321  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  51.78 
 
 		 324 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  51.28 
 
 		 324 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  51.08 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  51.84 
 
 		 324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  53.31 
 
 		 325 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  49.85 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  48.01 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  45.99 
 
 		 337 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  49.82 
 
 		 335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  48.74 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  44.68 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  44.91 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  48.64 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  50.74 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  45.26 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  44.92 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  43.1 
 
 		 325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  45.82 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  34.66 
 
 		 324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  31.99 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 317 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  30.79 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.31 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.26 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.07 
 
 		 322 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  34.97 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.09 
 
 		 325 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  35.63 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  31.56 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.67 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  29.55 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.15 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  30.61 
 
 		 325 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.87 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  30.28 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  31.23 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  30.11 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  29.55 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  32.07 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  31.11 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  31.87 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  30.23 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  28.25 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  28.69 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  24.83 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  36.05 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  35.47 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  31.09 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  27.02 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>