More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4618 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  100 
 
 		 325 aa  642    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  67.58 
 
 		 326 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  57.62 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  57.62 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  57.32 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  55.69 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  56.44 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  57.1 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  56.65 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  54.77 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  56.33 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  56.88 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  56.88 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  56.57 
 
 		 325 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  54.77 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  52.31 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  49.85 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  51.68 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  49.24 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  45.71 
 
 		 330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  46.22 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  40.2 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  48 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  40 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  37.07 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  36.42 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  38.7 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  36.17 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  43.22 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  35.47 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  35.97 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  37.72 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  35.71 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  36.33 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  35.71 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 317 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  41.38 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  32.72 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  32.77 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  42.49 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  32.81 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  34.78 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  34.02 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  34.02 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  31.37 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  31.37 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  30 
 
 		 327 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 310 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  37.3 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 660 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  31.79 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  38.78 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  34.17 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  40.96 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  38.27 
 
 		 282 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  35.42 
 
 		 316 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 329 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  31.21 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  36.51 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  37 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 275 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  39.89 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  30.13 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  37.22 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  31.12 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  33.47 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  29.1 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  32.03 
 
 		 334 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.61 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  33.83 
 
 		 319 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.52 
 
 		 324 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 324 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  33.06 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.81 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  29.14 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.71 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  35.29 
 
 		 331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>