215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002650 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 322 aa  651    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  36 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  36.88 
 
 		 325 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  34.76 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  33.54 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.34 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.34 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  34.23 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  32.93 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.72 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.9 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  32.55 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  32.21 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  32.09 
 
 		 325 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  30.17 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  28.04 
 
 		 321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.72 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  30.96 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  31.33 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.55 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  36.87 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.91 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  29.79 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  29.45 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  35.18 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  35.5 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 660 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  28.48 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.11 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  31.61 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  34.55 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  36.72 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.25 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  26.49 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  29.24 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.15 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  28 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 336 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.7 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 310 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  27.96 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  33.33 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  31.33 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 337 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  33.69 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.18 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.3 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.99 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  29.53 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  31.22 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  30.49 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>