247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0654 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  100 
 
 		 322 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  58.73 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  61.8 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  37.27 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  35.6 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  38.46 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  34.62 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  39 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  36.79 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  38.67 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  44.83 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  36.24 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  36.24 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  45.03 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  36.45 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  36.45 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  41.87 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  36.12 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  36.48 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  41.18 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  44.2 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  33.64 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  34.48 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  41.15 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  40.49 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  33.11 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  35.34 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  37.38 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  34.06 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  32.07 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  34.8 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  34.8 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  37.17 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  40.2 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  33.22 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  37.93 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  36.6 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  34.55 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  32.66 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.46 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  37.75 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  37.36 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.35 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  36.81 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  40.8 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  28.62 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  34.36 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  35.78 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  39.04 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  33.86 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  38.97 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  33.86 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 324 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  32.89 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  34.78 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  36.36 
 
 		 325 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  36.32 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.52 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  31.8 
 
 		 325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  28.88 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.25 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  33.96 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  36.57 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  36.57 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.39 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  36.57 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 660 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  36.57 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  36 
 
 		 330 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  38.22 
 
 		 326 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 310 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  31.12 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.99 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  27.24 
 
 		 322 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  32.88 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>