226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3965 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  100 
 
 
320 aa  627  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  63.47 
 
 
320 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  62.81 
 
 
320 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  53.27 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  35.15 
 
 
325 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  35.65 
 
 
325 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  35.48 
 
 
325 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  35.46 
 
 
325 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  36.46 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  34.81 
 
 
325 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  35.5 
 
 
325 aa  193  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  34.81 
 
 
325 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  34.81 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  35.29 
 
 
325 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  34.24 
 
 
325 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  37.41 
 
 
325 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  37.41 
 
 
325 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  37.41 
 
 
325 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.67 
 
 
326 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  33.44 
 
 
321 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  36.24 
 
 
325 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  35.45 
 
 
321 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  35.19 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  32.26 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  34.72 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  36.51 
 
 
321 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  33.63 
 
 
332 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  31.9 
 
 
325 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  33.87 
 
 
322 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  30.77 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  30.58 
 
 
325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  33.87 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  31.86 
 
 
321 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  37.81 
 
 
323 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  40.69 
 
 
325 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  37.55 
 
 
322 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.96 
 
 
322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  42.19 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  32.04 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  34.26 
 
 
334 aa  139  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  33.47 
 
 
335 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  33.2 
 
 
337 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.69 
 
 
322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  34.98 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  34.27 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  37.91 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.78 
 
 
317 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  34.35 
 
 
328 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  34.9 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  34.27 
 
 
336 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.35 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  34.8 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  31.7 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  36.46 
 
 
322 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.22 
 
 
322 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  34.47 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.79 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  28.52 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  39.89 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  35.68 
 
 
324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  33.62 
 
 
337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  38.71 
 
 
322 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  38.71 
 
 
322 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  32.5 
 
 
316 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  29.66 
 
 
328 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.58 
 
 
660 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  35.2 
 
 
327 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  35.2 
 
 
327 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  33.7 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  32.31 
 
 
309 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  35.33 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  30.59 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  37.8 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  32.77 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  31.88 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  33.19 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  26.96 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  37.21 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.5 
 
 
326 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.88 
 
 
324 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  30.67 
 
 
325 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  31.67 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  32.24 
 
 
310 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.98 
 
 
324 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  31.52 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  31.05 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.83 
 
 
323 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.52 
 
 
324 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  33.88 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  30.8 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.52 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  29.67 
 
 
327 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.2 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  31.52 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  32.95 
 
 
323 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  32 
 
 
282 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  29.33 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  33.15 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.57 
 
 
324 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  33.33 
 
 
319 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>