230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2365 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 325 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  74.46 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  35.5 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.72 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 325 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  33.55 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  33.23 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.81 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  33 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.98 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  32.71 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  30.98 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  31.83 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  39.34 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.49 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  34.36 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.14 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  37.97 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  37.02 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  40.23 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  40 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  38.92 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  29.69 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  28.71 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 323 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  35.04 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.8 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 327 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  38.69 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  33.85 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.24 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  38.12 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.99 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.7 
 
 		 333 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  34.62 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 660 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  29.22 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  26.36 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  39.47 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.17 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.23 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  27.72 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  33.16 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  34.07 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 282 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  35.09 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  33.14 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  32.54 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  29.28 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 283 aa  95.9  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32.42 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.22 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  31.18 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>