216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2934 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  100 
 
 		 310 aa  613  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  75 
 
 		 310 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  52.1 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  43.37 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  46.3 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  44.64 
 
 		 310 aa  215  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  35.2 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  36 
 
 		 660 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  38.19 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  38.19 
 
 		 327 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  33.72 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  34.53 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 325 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  33.19 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  30.9 
 
 		 325 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  35.18 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  36.7 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  35.36 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  35.63 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  36.11 
 
 		 325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  37.21 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  34.05 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  28.42 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.79 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  31.65 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.57 
 
 		 290 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 330 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  39.18 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  27.11 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  32.88 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.43 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  35 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  35 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  35 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  33 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  30.49 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  36.21 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  32.28 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  30.71 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  35.56 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  32.34 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  31.87 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.06 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  31.49 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  32.42 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.39 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.76 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  31.6 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  27.83 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  31.42 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.73 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  32.43 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  34.39 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  30 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.94 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  32.23 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  33.33 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  32.97 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  32.97 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  33.91 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  28.72 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>