More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1529 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  100 
 
 		 330 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  48.28 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  47.37 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  45.71 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  45.4 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  45.31 
 
 		 325 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  46.39 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  48.74 
 
 		 325 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  48.43 
 
 		 325 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  48.11 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  48.43 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  45 
 
 		 325 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  46.75 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  47.08 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  45.93 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  45.6 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  45.6 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  45.6 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  42.09 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  40.8 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  39.13 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  38.63 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  40.32 
 
 		 321 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  38.12 
 
 		 321 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  38.41 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  39.34 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  37.54 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  43.72 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  32.29 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  39.66 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  34.93 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  32.53 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 320 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  31.8 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  37.45 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  35.67 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  32.25 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  33.99 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  30.79 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 320 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  35.9 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  31.83 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  32.41 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  32.37 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  29.94 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  41.75 
 
 		 313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  27.71 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  33.47 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  31.95 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  35.86 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  34.52 
 
 		 660 aa  135  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.62 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.05 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  30.08 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.73 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  37.95 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.04 
 
 		 336 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.38 
 
 		 324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.74 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  33.85 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  31.06 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  30.54 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  32.29 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  29.33 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  31.08 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 324 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  32.14 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  31.7 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  32.51 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  36.7 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  34.81 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>