248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1814 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  30.36 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  31.72 
 
 		 315 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.85 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  32.57 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.7 
 
 		 332 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.58 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 324 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 330 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.67 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  32.52 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.5 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.63 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.72 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 320 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 321 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.67 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 327 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 317 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  27.5 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25.5 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 325 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  29.34 
 
 		 324 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.65 
 
 		 322 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  29.58 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  25.96 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 293 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 279 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 325 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 325 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  24.87 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 321 aa  92.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.8 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  27.57 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  30.81 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  28.72 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.35 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.15 
 
 		 325 aa  89  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25.26 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.51 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  30.48 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  24.89 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25.76 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.3 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 310 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  24.15 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  26.73 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.35 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.21 
 
 		 310 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  27.89 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  27.18 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  26.99 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  23.19 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 660 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  23.04 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>