184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4394 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  84.07 
 
 		 295 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  61.9 
 
 		 293 aa  345  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  51.6 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  43.98 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  48.9 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  44.62 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  34.86 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  33.47 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  34.48 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 342 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  32.58 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  30.74 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  33.82 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 312 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  33.62 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  33.62 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  33.62 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  35.14 
 
 		 326 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  34.58 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  31.17 
 
 		 359 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  36.84 
 
 		 336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  35.94 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  35.94 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  35.94 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  30.97 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  31.21 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  31.63 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  31.63 
 
 		 313 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 335 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.8 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  30.51 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 324 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.45 
 
 		 660 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 325 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 324 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 325 aa  89.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  23.88 
 
 		 323 aa  89.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29 
 
 		 326 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.43 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 333 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  27.3 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.55 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 321 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 324 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 336 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.59 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 325 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.58 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.89 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.25 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.14 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.73 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  27.14 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>