171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4251 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  100 
 
 		 308 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  80.84 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  52.27 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  57.24 
 
 		 312 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  37.8 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  47.69 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  43.93 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  49.2 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  49.2 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  49.2 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  49.2 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  49.2 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  49.2 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  49.74 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  38.04 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  51.61 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  44.28 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  48.92 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  45.05 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  34.81 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  33.01 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  36.04 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  34.04 
 
 		 293 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  24.92 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  32.62 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  31.28 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  32.6 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.89 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  24.88 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.63 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.25 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  23.57 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.32 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.2 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  23.59 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.64 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.7 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.58 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  22.04 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  24.4 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  25.25 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25.59 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.54 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  27.55 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  24.69 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  28.92 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  22.7 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.6 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  22.51 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.77 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.08 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  23.15 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  20.96 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  23.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.86 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  23.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  23.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  22.49 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>