167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2069 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  100 
 
 		 320 aa  630  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  47.98 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  47.98 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  50.27 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  53.8 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  36.76 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  38.91 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  38.91 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  38.91 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  49.18 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  46.7 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  38.63 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  42.31 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  35.37 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  46.99 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  41.23 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  40.57 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  44.81 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  44.81 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  44.81 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  44.81 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  44.81 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  44.81 
 
 		 335 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  35.11 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  34.21 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  32.83 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  32.83 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  29.46 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  29.81 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  30 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  32.58 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.48 
 
 		 323 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.05 
 
 		 314 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  30 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.21 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  27.23 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  27.75 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.39 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.17 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 320 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.84 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.13 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  29.25 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  30.46 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  30.53 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24.81 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  22.39 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  23.73 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.67 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.72 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  22.87 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.72 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  27.35 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  23.55 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  24.16 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.43 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  27.78 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  25.74 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  23.67 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  21.39 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  23.37 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  24.74 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  27.27 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  28.96 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  22.28 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>