176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2323 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  39.5 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  38.06 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 330 aa  145  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  35.03 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  41.53 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  36.78 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  36.78 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  38.25 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  36.49 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  38.95 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  38.17 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  37.31 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  38.42 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  38.42 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  36.61 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  36.61 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  36.61 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  37.16 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  36.16 
 
 		 241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  35.52 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  30.64 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  32.25 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  35.71 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  29.08 
 
 		 295 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  33.53 
 
 		 302 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  29.28 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  23.48 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.01 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  25.19 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  25.4 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.9 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.23 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  24.51 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.1 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.22 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  27.45 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25.14 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  25.73 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.32 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.15 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  26.69 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  23.53 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.25 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24.56 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  23.67 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  25.15 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  25.93 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.12 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  25.73 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  23.94 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  21.38 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  25 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  23.98 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  25.34 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>