169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2795 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  100 
 
 		 359 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  83.09 
 
 		 342 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  50.28 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  52.79 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  52.51 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  52.51 
 
 		 326 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  65.35 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  50.42 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  56.15 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  56.15 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  56.15 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  54.47 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  54.47 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  54.47 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  67.48 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  71.51 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  55.08 
 
 		 241 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  55.25 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  45.9 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  45.9 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  43.46 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  46.15 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  46.96 
 
 		 318 aa  170  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  46.99 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  37.99 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  37.31 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  37.31 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  31.73 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  31.92 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  34.59 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  36.46 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  35.03 
 
 		 294 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  34.66 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 302 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.4 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  26.55 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.75 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.67 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  25.59 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  30.6 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  25.11 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  27.24 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  35.83 
 
 		 660 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  25 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  29.74 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.36 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.06 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.11 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  25.58 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  26.5 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.55 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  22.34 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.29 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  23.95 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.79 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  24.59 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  23.33 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  24 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.74 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  29.22 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.26 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  27.07 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>