173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2324 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  45.03 
 
 
241 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  42.47 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  45.16 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  46.24 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  46.24 
 
 
326 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  46.24 
 
 
326 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  45.16 
 
 
335 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  45.16 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  45.16 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  45.16 
 
 
335 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  45.16 
 
 
335 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  45.16 
 
 
306 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  46.96 
 
 
359 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  44.86 
 
 
326 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  35.47 
 
 
330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  38.4 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  35.17 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  44.62 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  38.02 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  38.02 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  38.27 
 
 
309 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  45.21 
 
 
312 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  42.11 
 
 
320 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  29.39 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  29.39 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  32.45 
 
 
293 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  32.57 
 
 
303 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  30.98 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  29.95 
 
 
293 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  32.56 
 
 
291 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.22 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  30.68 
 
 
295 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  27.96 
 
 
325 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  28.92 
 
 
294 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.03 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  27.2 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  27.2 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  28.03 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  28.9 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  31.25 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.4 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  30.05 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.78 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.55 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  28.34 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  25.77 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  26.35 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  25.95 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  25.91 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  26.01 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  29.89 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.45 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  22.83 
 
 
325 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  31.18 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  25 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  30.85 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  24.86 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  28.8 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  26.47 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  25.2 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  22.98 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  26.75 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  29.34 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.12 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.36 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  27.36 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  26.32 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25.38 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.3 
 
 
323 aa  67  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  23.53 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.47 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  22.42 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  27.03 
 
 
317 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  21.89 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  23.08 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  25.29 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  24.55 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.37 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  25.1 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.84 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.84 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  23.69 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  24.1 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  21.66 
 
 
334 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.95 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  26.52 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  23.08 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  26.29 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  27.35 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.55 
 
 
324 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.84 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.66 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  21.86 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  22.7 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  21.86 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  27.69 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  21.05 
 
 
328 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  26.01 
 
 
324 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>