192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2159 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  100 
 
 
294 aa  563  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  39.18 
 
 
293 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  40.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  38.13 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  34.43 
 
 
303 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  44.21 
 
 
293 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  41.99 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  41.44 
 
 
293 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  35.19 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  35 
 
 
291 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  35.83 
 
 
359 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  33.86 
 
 
241 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  33.97 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  34.34 
 
 
308 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  31.91 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  31.91 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  31.91 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  33.17 
 
 
322 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.34 
 
 
325 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  33.17 
 
 
336 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  32.22 
 
 
326 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  30.36 
 
 
325 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  33.48 
 
 
308 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  33.48 
 
 
308 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  33.15 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  31.75 
 
 
306 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  31.75 
 
 
306 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  31.75 
 
 
306 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  31.75 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  31.75 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  31.75 
 
 
335 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  32.97 
 
 
312 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  27.56 
 
 
323 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  32.99 
 
 
309 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.55 
 
 
325 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  30.31 
 
 
318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.05 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.3 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  26.13 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  28.49 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  29.47 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  32.78 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  32.61 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  32.78 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  26.72 
 
 
325 aa  92.4  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.34 
 
 
325 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  27.92 
 
 
325 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.34 
 
 
325 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.34 
 
 
325 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  35.36 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  29.56 
 
 
314 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.81 
 
 
317 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  28.09 
 
 
325 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  32.98 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  30.06 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.03 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  28.88 
 
 
325 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.19 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.2 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.21 
 
 
330 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  27.96 
 
 
291 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  28.95 
 
 
325 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  24.8 
 
 
332 aa  87  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.16 
 
 
325 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  25.53 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  24.81 
 
 
338 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  30.43 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.19 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  28.05 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.15 
 
 
322 aa  84  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  28.65 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  25.48 
 
 
325 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.83 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  24.54 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  27.19 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  28.83 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.77 
 
 
660 aa  82.4  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  33.55 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  25.88 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.63 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.08 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.24 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  27.06 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  31.58 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  22.43 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  23.93 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.97 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.72 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  29.75 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23.65 
 
 
321 aa  79  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  29.11 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  27.86 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  28.21 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  24.26 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  28.57 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  25.91 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.93 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.93 
 
 
323 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>