188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  86.39 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  42.29 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  45.12 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  43.39 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  49.73 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  40.29 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  34.08 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  32.56 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  37.3 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  35.03 
 
 		 359 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  35.12 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  33.81 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  34.83 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  31.82 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  34.25 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  31.25 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  32.96 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  32.96 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  32.96 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  33.7 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  35.36 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 326 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  33.9 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  32.16 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  34.1 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 323 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.2 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  29.05 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.6 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  34.84 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  30.31 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  30.31 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.72 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.84 
 
 		 325 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  27.8 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  30 
 
 		 322 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 325 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  25.67 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  31.25 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.06 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.39 
 
 		 334 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  31 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  26.02 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  30.11 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  30.11 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  25 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  28.73 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.08 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  26.23 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 337 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  29.63 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  28 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  26.78 
 
 		 324 aa  89  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.17 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 336 aa  89  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  30 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  30.43 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 325 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.09 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27.68 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.65 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  28 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  25.51 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.89 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  29.49 
 
 		 325 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.28 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  26.55 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.67 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  28.46 
 
 		 660 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  29.66 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  28.22 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.75 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>