202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0845 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  54.42 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  53.38 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  49.65 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  42.8 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  49.17 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  45.11 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  38.76 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  33.01 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  36.44 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  37.25 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  35.75 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  35.91 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  37 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  34.59 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  35.1 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  34.68 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  37.7 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  34.43 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  34.22 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 306 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  34.22 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  30.4 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  34.22 
 
 		 335 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  34.95 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  33.88 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  30.47 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  31.46 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  31.65 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  32.94 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.79 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  31.22 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  31.22 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  26.6 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  29.04 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.85 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  30.73 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  33.51 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  27.76 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  30.6 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.41 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.53 
 
 		 325 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  32.38 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  29.95 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  32.22 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  32.3 
 
 		 336 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  30.05 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  26.7 
 
 		 325 aa  95.5  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.26 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  32.16 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  31.67 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  30.34 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 310 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 335 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 321 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  30.09 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.11 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  32.78 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  29.36 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  29.31 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  32.4 
 
 		 320 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 322 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.63 
 
 		 321 aa  89.4  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 325 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  30.11 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  26.82 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>