180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1729 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  100 
 
 
330 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  81.82 
 
 
330 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  65.91 
 
 
322 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  59.81 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  57.27 
 
 
326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  59.81 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  59.81 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  57.27 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  57.27 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  57.53 
 
 
335 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  57.53 
 
 
335 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  57.53 
 
 
335 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  58.05 
 
 
336 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  56.97 
 
 
326 aa  315  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  50 
 
 
342 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  49.12 
 
 
359 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  37.8 
 
 
308 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  37.8 
 
 
308 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  51.04 
 
 
241 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  49.3 
 
 
312 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  43.1 
 
 
308 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  53.97 
 
 
309 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  34.84 
 
 
320 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  34.42 
 
 
318 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  33.47 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  41.53 
 
 
313 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  41.53 
 
 
313 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  33.06 
 
 
295 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  37.63 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  35.75 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  29.01 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  34.08 
 
 
294 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  35.2 
 
 
293 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  33.97 
 
 
294 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  30.59 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  26.56 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  23.89 
 
 
325 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  27.82 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  26.89 
 
 
322 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  28.36 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.3 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  25.83 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.62 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  25.41 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  25.31 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  25.2 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  23.59 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  26.92 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.8 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  25 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.29 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25.1 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  25.2 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.75 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  24.49 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  27.17 
 
 
324 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  23.23 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  23.89 
 
 
325 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  24.26 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  24.26 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  25.76 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  25.13 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  26.74 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  23.76 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  30 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  24.79 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  24.06 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  26.55 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.11 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  25.41 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  22.84 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.74 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.21 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.32 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  23.66 
 
 
660 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  23.05 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.69 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  25.41 
 
 
321 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  25.88 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  25.41 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.91 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  25.23 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  25 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  23.4 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  24.46 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.64 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  23.4 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0073  type II secretion system protein  23.49 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53899  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  22.09 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  24.32 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  25.58 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.46 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.41 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>