194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0645 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  63.54 
 
 		 294 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  62.16 
 
 		 295 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  54.48 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  46.04 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  54.95 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  40.58 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  33.44 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1656  type II secretion system protein  34.8 
 
 		 342 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1446  type II secretion system protein  36.27 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1729  type II secretion system protein  37.63 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108814 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1406  type II secretion system protein  34.8 
 
 		 322 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02591  pilus assembly transmembrane protein  36.1 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4448  type II secretion system protein  38.5 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  37.99 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1500  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 326 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000537712 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1775  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.628418  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0120  hypothetical protein  36.76 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0013193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1045  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.506555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1945  putative fimbriae-related outer membrane protein  36.76 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000171773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1044  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1524  type II secretion system protein  35.48 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.437925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1771  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1792  type II secretion system protein  36.76 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0984165  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3657  type II secretion system protein, pilus assembly, transmembrane part  36.27 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2539  hypothetical protein  38.12 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4251  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.474366  normal  0.45717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4361  type II secretion system protein  31.39 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.395481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4664  Flp pilus assembly protein TadB  34.59 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265819  decreased coverage  0.000651584 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5412  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.63 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.56 
 
 		 325 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  32.16 
 
 		 322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2069  type II secretion system protein  34.95 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.807622  normal  0.805179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  31.34 
 
 		 330 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1660  type II secretion system protein  37.21 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  33.63 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2323  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2701  tight adherence protein TadB, putative  33.17 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.938711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  31.34 
 
 		 322 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.8 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  31.35 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  35 
 
 		 334 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  29.21 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  28.47 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.44 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2324  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  30.65 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.77 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  28.82 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  29.9 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  30.65 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  30.3 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  28.44 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  27.13 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  27.52 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 660 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 310 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  32.3 
 
 		 335 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  28.01 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  29.41 
 
 		 335 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  27.42 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  27.42 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  33.89 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  32.06 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 333 aa  93.2  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  24.64 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.93 
 
 		 325 aa  93.2  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  27.87 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 320 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  26.89 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  29.67 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 328 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  30.81 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  29.94 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.12 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  27.65 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  27.39 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>