180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0609 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  100 
 
 		 302 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  50.98 
 
 		 300 aa  296  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  46.05 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  44.88 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0598  type II secretion system protein F domain  39.55 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0681  type II secretion system protein  38.98 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0261  type II secretion system protein F domain  38.98 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000564215  hitchhiker  0.000000175169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  31.89 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  34.43 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  31.03 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 324 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  27.57 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 324 aa  89  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.11 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  29.47 
 
 		 337 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  28.07 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  28.14 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  25.89 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 325 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.03 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  26.14 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  29.87 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  27.22 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.09 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  25.6 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  25.77 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  29.22 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  25.97 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  27.92 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  25.85 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.28 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25.34 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  28.37 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  26.62 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.81 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  24.84 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25.14 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.83 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  24.57 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.82 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  24.84 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  24.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25.44 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  25.13 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  24.16 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.87 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  25.71 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.14 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  25.99 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  22.35 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  24.5 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  21.54 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  23.9 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.51 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.32 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  24.23 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  23.49 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  23.01 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>