210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0538 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  100 
 
 		 322 aa  617  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  41.82 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13150  Flp pilus assembly protein TadB  40.07 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  25.74 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.91 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  25.21 
 
 		 322 aa  96.3  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.37 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.88 
 
 		 660 aa  92.4  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  29.13 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  26.56 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  31.31 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  23.88 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  26.91 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.1 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.47 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  26.05 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  24.24 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  24.61 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  25.45 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  25.78 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32.04 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  27.63 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.4 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.83 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.59 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25.83 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  24.2 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  21.46 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  28.26 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  26.82 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.6 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  20.1 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  22.19 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  23.14 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  27.03 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  28.42 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.49 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  22.19 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  24.31 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  27.87 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  21.72 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23.27 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03348  Flp pilus assembly protein TadB  26.79 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  25.86 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.06 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  25.51 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  23.19 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  27.27 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  22.16 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  24.45 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  23.94 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  25.42 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  27.78 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  22.73 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  23.89 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  22.94 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  24.17 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  24.62 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1711  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  31.4 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  24.85 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0773  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  30.3 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.544997  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  33.04 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  22.95 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  21.59 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>