181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0773 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0773  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  100 
 
 		 285 aa  563  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.544997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  27.43 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  27.97 
 
 		 321 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  26.38 
 
 		 323 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  28.89 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  24.68 
 
 		 323 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 660 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  28.64 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  28.65 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.55 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  29.57 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  30.39 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  27.98 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  31.18 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.53 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  27.96 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  28.78 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55880  hypothetical protein  32.43 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  29.36 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  26.14 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2020  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.243296  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  24.59 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  24.27 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4868  hypothetical protein  31.76 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  27.66 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  30.94 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  25.43 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  30.22 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  25.48 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  28.06 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  26.74 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  30.1 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  24.9 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32.64 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  28.99 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  21.36 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  27.6 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  24.69 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  26.29 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  28.57 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  30 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  29.19 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  28.16 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  29.38 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  25.54 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  26.23 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  25.68 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  23.53 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  25.96 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  24.28 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  24.12 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  24.65 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  27.53 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  23.03 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.4 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  25.82 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  23.7 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  24.86 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  27.04 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  29.07 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  28.35 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>