196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 332 aa  662    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  43.06 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13150  Flp pilus assembly protein TadB  35.29 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  31.98 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  26.34 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  23.75 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1516  putative Type II secretion system protein precursor  26.88 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.0992648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  24.78 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  28.18 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  24.75 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  24.48 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  27.32 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  24.56 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  25.57 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25.58 
 
 		 660 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.57 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  24.16 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  23.32 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  26.7 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  20.83 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  25.84 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  31.32 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  25 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  28.99 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  26.67 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  26.42 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  28.17 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  22.19 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0773  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  29.88 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.544997  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  25.42 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  25 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  26.44 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  29.07 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  22.83 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  26.18 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  22.91 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  30.11 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  26.88 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  26.86 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  25.57 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0781  Type II secretion system F domain protein  28.03 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00253796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2159  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.01997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  23.76 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.76 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  24.42 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  20.69 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  24.04 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  25.22 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  22.29 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  26.47 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  23.73 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  23.6 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  29.55 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  24.02 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2795  putative tight adherence TadB related transmembrane protein  26.07 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136079  normal  0.229715 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  24.73 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  20.9 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  22.53 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.52 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  26.95 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  25.95 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  23.38 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  24.55 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  25.14 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  27.62 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>