242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1516 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1516  putative Type II secretion system protein precursor  100 
 
 		 329 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.0992648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  59.56 
 
 		 319 aa  361  8e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4001  type II secretion system protein  31.48 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3932  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0420764  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3425  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263373  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2045  hypothetical protein  38.92 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0674023  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0829  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1676  Flp pilus assembly protein TadB  38.92 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0332  hypothetical protein  38.92 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.100771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1877  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.395121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1889  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  36.67 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  28.42 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2455  pilus assembly protein, putative  38.38 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  33.69 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  37.57 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2017  type II secretion system protein  38.46 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  34.38 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2053  type II secretion system protein  38.73 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000824726  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 335 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  30.84 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  36.67 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  30.57 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.32 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  30.73 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  32.17 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  32.99 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  34.18 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  28.81 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  30.85 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  30.22 
 
 		 330 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3491  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0435404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  33.16 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  32.45 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.82 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  30.21 
 
 		 327 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  31.38 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  27.87 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  34.03 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  32.63 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  28.63 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  29.54 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  29.54 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  40.24 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  28.84 
 
 		 327 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  30.87 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  28.95 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  28.8 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  30.14 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  33.73 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  31.96 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  30.41 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  33.52 
 
 		 325 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  31.79 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  33.65 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  31.68 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.63 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  36.21 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  32.26 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  31.91 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 325 aa  99.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  31.89 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  33.7 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  31.86 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  31.1 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  27.18 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  31.49 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  31.58 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2046  type II secretion system protein  31.91 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  36.9 
 
 		 320 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  30.88 
 
 		 325 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2831  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  29.65 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  34.58 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  29 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  28.49 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  30.69 
 
 		 660 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  32.75 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.34 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  32.02 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  30.17 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  32.48 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30.43 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  29.89 
 
 		 295 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.98 
 
 		 275 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0899  Type II secretion system F domain protein  29.24 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>