203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1033 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0538  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  30.96 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  26.24 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  30.12 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0248  type II secretion system protein  24.66 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  25 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  28.31 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13150  Flp pilus assembly protein TadB  24.18 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  25 
 
 		 322 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  27.22 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  24.61 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  22.71 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  25.41 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.58 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002650  flp pilus assembly protein TadB  26.79 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  24.34 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  25.81 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  25.14 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  24.86 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  23.58 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  25 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  25 
 
 		 660 aa  65.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0643  type II secretion system protein  22.62 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0681  type II secretion system protein  23.5 
 
 		 291 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0310  type II secretion system protein  25.5 
 
 		 329 aa  65.5  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.873631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  23.26 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0261  type II secretion system protein F domain  22.53 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000564215  hitchhiker  0.000000175169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  23.21 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  24.03 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  23.78 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0598  type II secretion system protein F domain  21.98 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  27.51 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 535 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  23.08 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  25.62 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  24.57 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2695  type II secretion system protein  26.16 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0973564  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  27.81 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  26.39 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  26.46 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  25.3 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20340  Flp pilus assembly protein TadB  27.62 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  0.127493 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  25.3 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  26.46 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3511  type II secretion system protein  30.63 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798024  normal  0.0839848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  25.93 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4854  hypothetical protein  21.64 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0747  type II secretion system protein  21.05 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2693  type II secretion system protein  22.22 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  23.16 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  24.14 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4394  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  23.21 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  26.71 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  23.04 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  20.63 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2275  putative integral membrane protein  23.41 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  23.16 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2412  type II secretion system protein  22.59 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2365  Flp pilus assembly protein TadB  25.39 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0315564  normal  0.0552567 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0373  type II secretion system protein F  24.12 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.232118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  23.83 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  23.04 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  20.57 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0645  type II secretion system protein  22.54 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0845  type II secretion system protein  19.49 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1338  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  23.5 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  24.1 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  23.56 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  21.43 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  23.36 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  23.58 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0297  type II secretion system protein  23.28 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3780  Type II secretion system F domain protein  27.07 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 324 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06192  Flp pilus assembly protein TadB  23.32 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  26.2 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1516  putative Type II secretion system protein precursor  22.63 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.0992648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  22.89 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0671  type II secretion system protein  23.81 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.732749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  26.87 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0609  type II secretion system protein  24.47 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  27.01 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  20.86 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0709  putative type II secretion system protein F  19.61 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  23.29 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  25.29 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1639  type II secretion system protein  21.89 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.473605  normal  0.315413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  23.93 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>