217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1237 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  100 
 
 		 309 aa  565  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  61.89 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  49.52 
 
 		 316 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  47.25 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  56.85 
 
 		 315 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  50 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  45.83 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  51.1 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  48.7 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  45.39 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  46.4 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  45.34 
 
 		 314 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  50.65 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  48.06 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  49.13 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  44.37 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  29.15 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  30.56 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  29.02 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  27.46 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  31.07 
 
 		 309 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  32.91 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  30.19 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  34.27 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  32.09 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  27.85 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  29.62 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  28.28 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  31.64 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  28.75 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  25.76 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  33.47 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  33.72 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  33.12 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  32 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  29.82 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3208  type II secretion system protein  27.94 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.544767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  29.11 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1053  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  31.01 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  23.29 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  26.11 
 
 		 643 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  26.09 
 
 		 323 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  30 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  29.44 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  25 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  25 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  29.51 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  35.61 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  29.52 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  24.85 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  28.31 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  27.16 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  26.96 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  29.75 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2314  type II secretion system protein  24.69 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  29.61 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.11 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  25.91 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3011  type II secretion system protein  28.15 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0793  TadC protein  27.81 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  25.45 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1524  type II secretion system protein  29.52 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  25.56 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4619  type II secretion system protein  26.52 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  28.02 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  26.35 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  22.76 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  26.92 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  26.92 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  26.5 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  25.49 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  28.5 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  28.4 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.41 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  25 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  27.86 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2911  type II secretion system protein  29.2 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  27.22 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2832  type II secretion system protein  26.59 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  24.88 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  28.4 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  27.23 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0653  TadC protein  26.63 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5120  type II secretion system protein  26.29 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2454  type II secretion system protein F  28.46 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0182293  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  22.63 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0880  type II secretion system protein  36.21 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  28.57 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0992  type II secretion system protein  23.6 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236675  normal  0.765371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4002  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0289268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>