154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10340  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 309 aa  587  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00075176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0781  type II secretion system protein  50.16 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1737  type II secretion system protein  45.72 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5824  type II secretion system protein  47.04 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2406  type II secretion system protein  43.4 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0371172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  43.54 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20400  Flp pilus assembly protein TadB  43.97 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1254  type II secretion system protein  46.18 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1031  type II secretion system protein  44.83 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1211  Type II secretion system F domain protein  47.88 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1649  type II secretion system protein  43.06 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.2409  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2789  type II secretion system protein  47.29 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07520  Flp pilus assembly protein TadC  42.81 
 
 		 313 aa  182  7e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1237  Type II secretion system F domain protein  49.3 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0858  type II secretion system protein  38.49 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3787  type II secretion system protein  44.25 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0665963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4615  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2118  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.128736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4157  type II secretion system protein  30.36 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3212  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.514288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3350  type II secretion system protein  31.02 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2641  type II secretion system protein  29.71 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2557  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.59617  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1850  type II secretion system protein  33.2 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102974  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3118  type II secretion system protein  31.54 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4446  type II secretion system protein  29.32 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044747 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2649  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1276  type II secretion system protein  25.72 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1318  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2968  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3093  type II secretion system protein  30.86 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1680  type II secretion system protein  26.37 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0639  type II secretion system protein  32.74 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.3 
 
 		 643 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1043  Type II secretion system F domain protein  31.97 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.809436  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1204  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.59428  hitchhiker  0.000000109908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0586  type II secretion system protein  33.33 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.180812  normal  0.546922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2276  hypothetical protein  29.71 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2365  hypothetical protein  29.34 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.195084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  30.25 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2696  type II secretion system protein  32.7 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0581937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2114  type II secretion system protein  28.2 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2763  type II secretion system protein  30 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.613586 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2486  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.766494  hitchhiker  0.000200331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0249  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2698  type II secretion system protein  29.31 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2352  type II secretion system protein  30.63 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2694  type II secretion system protein  32.8 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1124  type II secretion system protein  29.12 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0315206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2650  type II secretion system protein  26.45 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7193  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.1 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.456008 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6300  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.923016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2935  type II secretion system protein  25.66 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1032  type II secretion system protein  32.39 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1813  type II secretion system protein  27.03 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00328504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6004  type II secretion system protein  30.06 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1107  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107682  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2016  type II secretion system protein  27.33 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0767  Type II secretion system F domain protein  30.72 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0650  putative tight adherence TadC-related transmembrane protein  31.95 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.640477  normal  0.167986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5490  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6776  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6364  type II secretion system protein  27.37 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2047  type II secretion system protein  28.9 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0677944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1517  hypothetical protein  31.4 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.205257  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2923  putative type II secretion system protein F  26.36 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0300  type II secretion system protein  28.41 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1399  type II secretion system protein  30.37 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0535811  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1754  Flp pilus assembly protein TadC  27.78 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0710  putative type II secretion system protein F  26.95 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0552  type II secretion system protein  29.03 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2307  Type II secretion system F domain protein  30.66 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2276  putative integral membrane protein  29.6 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.846433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1754  type II secretion system protein  29.19 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00143607  normal  0.105402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002651  type II/IV secretion system protein TadC associated with Flp pilus assembly  27.61 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1903  putative Flp pilus assembly protein TadC  29.03 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06191  hypothetical protein  24.61 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2736  type II secretion system protein  27.22 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13140  Flp pilus assembly protein TadC  29.7 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0672  type II secretion system protein  27.49 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1159  Type II secretion system F domain protein  25.32 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2364  putative putative tight adherence TadC-like transmembrane protein  25.47 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00226483  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1831  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0801  type II secretion system protein  30.32 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2927  type II secretion system protein  28.29 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0944491  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0642  type II secretion system protein  22.99 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1075  type II secretion system protein  28.98 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0424  type II secretion system protein  26.95 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.628499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2565  Type II secretion system F domain protein  35.64 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.725543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0806  type II secretion system protein  25.6 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1500  type II secretion system protein  27.07 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.34697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1530  type II secretion system protein  28.12 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0212  component of type IV pilus  25.3 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4864  type II secretion system protein  26.63 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2021  type II secretion system protein  27.71 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0900  Type II secretion system F domain protein  26.29 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0746  type II secretion system protein  20.87 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4188  type II secretion system protein  29.94 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2351  type II secretion system protein  29.6 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5326  type II secretion system protein  28.93 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0355396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>